BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB031E03SP1|AL429404
(945 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig1804 1861 0.0
3x_Contig1670 1591 0.0
>3x_Contig1804
Length = 51183
Score = 1861 bits (937), Expect = 0.0
Identities = 940/943 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aaatacwtttatttgctagctttcagctttgagtggaacatcagtcctccatatgaatcg 62
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Sbjct: 49507 aaatacttttatttgctagctttcagctttgagtggaacatcagtcctccatatgaatcg 49566
Query: 63 tatccgtagatatctagcgaaaatggccaatatcattaagataggaacctccaacaatgg 122
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Sbjct: 49567 tatccgtagatatctagcgaaaatggccaatatcattaagataggaacctccaacaatgg 49626
Query: 123 tccaaaagttgcagctatggcttgctgactatcgtttccataaatcgatattgcaacggc 182
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Sbjct: 49627 tccaaaagttgcagctatggcttgctgactatcgtttccataaatcgatattgcaacggc 49686
Query: 183 caacgataactcgaagttgttggaggctgttgtaaaacactgtgtcatagttatggggta 242
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Sbjct: 49687 caacgataactcgaagttgttggaggctgttgtaaaacactgtgtcatagttatggggta 49746
Query: 243 gcttgaactgcaagtctttttcccccaatttttctttagaagaagctgctcttgatcgca 302
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Sbjct: 49747 gcttgaactgcaagtctttttcccccaatttttctttagaagaagctgctcttgatcgca 49806
Query: 303 ttcgcatttttcatcgtcactgggctttgtgttcgttagatacctcatgaggacaaacgt 362
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Sbjct: 49807 ttcgcatttttcatcgtcactgggctttgtgttcgttagatacctcatgaggacaaacgt 49866
Query: 363 gaagctccaggcgaggatgaagtataagaccaaagggatgaaacacaagaaagcggatcc 422
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Sbjct: 49867 gaagctccaggcgaggatgaagtataagaccaaagggatgaaacacaagaaagcggatcc 49926
Query: 423 aatctcatgaatgaactgatacccacgactgacaaayaggatgcaaattgtatagtgaaa 482
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Sbjct: 49927 aatctcatgaatgaactgatacccacgactgacaaataggatgcaaattgtatagtgaaa 49986
Query: 483 gcctatcatagcccatggagatatgtatttgagaatatgcttttcataattgtgtttccc 542
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Sbjct: 49987 gcctatcatagcccatggagatatgtatttgagaatatgcttttcataattgtgtttccc 50046
Query: 543 aatactgtaaacaaatattaaacgaattagaatcccacaacataatggtattccaagaaa 602
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Sbjct: 50047 aatactgtaaacaaatattaaacgaattagaatcccacaacataatggtattccaagaaa 50106
Query: 603 tgcgctaacggacttggccacctcgctaaacattgcgttgtaagaaccctgaaaatggtc 662
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Sbjct: 50107 tgcgctaacggacttggccacctcgctaaacattgcgttgtaagaaccctgaaaatggtc 50166
Query: 663 atttgaaatcacgtagcagtatagtaattgtaaaggcgcatataggaccatctgcaatac 722
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Sbjct: 50167 atttgaaatcacgtagcagtatagtaattgtaaaggcgcatataggaccatctgcaatac 50226
Query: 723 cgaattgcaaacaaccaaaacaacacacaaatcgttatcaccaccagcaatttggttcca 782
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Sbjct: 50227 cgaattgcaaacaaccaaaacaacacacaaatcgttatcaccaccagcaatttggttcca 50286
Query: 783 aatcaataccattgcaatacatctggcgattcctatcattataataccctcacgatactc 842
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Sbjct: 50287 aatcaataccattgcaatacatctggcgattcctatcattataataccctcacgatactc 50346
Query: 843 tttgtgctcaaataaggctaaccatgccaaggccgtcattaacaatggtccaaaaatcca 902
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Sbjct: 50347 tttgtgctcaaataaggctaaccatgccaaggccgtcattaacaatggtccaaaaatcca 50406
Query: 903 gttgagaataagagatagcaataattgccyccatacatacttt 945
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Sbjct: 50407 gttgagaataagagatagcaataattgcctccatacatacttt 50449
>3x_Contig1670
Length = 9382
Score = 1591 bits (801), Expect = 0.0
Identities = 835/847 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 39 aacatcagtcctccatatgaatcgtatccgtagatatctagcgaaaatggccaatatcat 98
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Sbjct: 8536 aacatcatccctccatatgaatcgtatccgtagatatctagcgaaaatagccaatatcat 8595
Query: 99 taagataggaacctccaacaatggtccaaaagttgcagctatggcttgctgactatcgtt 158
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Sbjct: 8596 caagataggaacctccaacaatggcccaaaagttgcagctatggcttgctgactatcgtt 8655
Query: 159 tccataaatcgatattgcaacggccaacgataactcgaagttgttggaggctgttgtaaa 218
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Sbjct: 8656 tccataaatcgatattgcaacggccaacgataactcgaagttgttggaggctgttgtaaa 8715
Query: 219 acactgtgtcatagttatggggtagcttgaactgcaagtctttttcccccaatttttctt 278
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Sbjct: 8716 acactgtgtcatagttatggggtagtttgaactgcaagtctttttcccccaactcttttt 8775
Query: 279 tagaagaagctgctcttgatcgcattcgcatttttcatcgtcactgggctttgtgttcgt 338
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Sbjct: 8776 taggagaagctgctcttgatcgcattcgcatttttcatcgtcactgggctttgtgttcgt 8835
Query: 339 tagatacctcatgaggacaaacgtgaagctccaggcgaggatgaagtataagaccaaagg 398
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Sbjct: 8836 tagatacctcatgaggacaaacgtgaagctccaggcgaggatgaagtataagaccaaagg 8895
Query: 399 gatgaaacacaagaaagcggatccaatctcatgaatgaactgatacccacgactgacaaa 458
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Sbjct: 8896 gatgaaacacaagaaagcggatccaatctcatgaatgaactgatacccacgactgacaaa 8955
Query: 459 yaggatgcaaattgtatagtgaaagcctatcatagcccatggagatatgtatttgagaat 518
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Sbjct: 8956 taggatgcaaattgtatagtgaaagcctatcatagcccatggagatatgtatttgagaat 9015
Query: 519 atgcttttcataattgtgtttcccaatactgtaaacaaatattaaacgaattagaatccc 578
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Sbjct: 9016 atgcttttcataattgtgtttcccaatactgtaaacaaatattaaacgaattagaatccc 9075
Query: 579 acaacataatggtattccaagaaatgcgctaacggacttggccacctcgctaaacattgc 638
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Sbjct: 9076 acaacataatggtattccaagaaatgcgctaacggacttggccacctcgctaaacattgc 9135
Query: 639 gttgtaagaaccctgaaaatggtcatttgaaatcacgtagcagtatagtaattgtaaagg 698
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Sbjct: 9136 gttgtaagaaccctgaaaatggtcatttgaaatcacgtagcagtatagtaattgtaaagg 9195
Query: 699 cgcatataggaccatctgcaataccgaattgcaaacaaccaaaacaacacacaaatcgtt 758
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Sbjct: 9196 cgcatataggaccatctgcaataccgaattgcaaacaaccaaaacaacacacaaatcgtt 9255
Query: 759 atcaccaccagcaatttggttccaaatcaataccattgcaatacatctggcgattcctat 818
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Sbjct: 9256 atcaccaccagcaatttggttccaaatcaataccattgcaatacatctggcgattcctat 9315
Query: 819 cattataataccctcacgatactctttgtgctcaaataaggctaaccatgccaaggccgt 878
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Sbjct: 9316 cattataataccctcacgatactctttgtgctcaaataaagctaaccatgccaaggccgt 9375
Query: 879 cattaac 885
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Sbjct: 9376 cattaac 9382
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 6255
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 6255
Number of successful extensions: 44
Number of sequences better than 1.0e-20: 2
length of query: 945
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 929
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 9596234631
effective search space used: 9596234631
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.8 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.8 bits)